Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms