Protein–RNA interactions for Protein: P28702

RXRB, Retinoic acid receptor RXR-beta, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRBP28702 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RXRBP28702 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RXRBP28702 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RXRBP28702 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RXRBP28702 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RXRBP28702 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RXRBP28702 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RXRBP28702 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RXRBP28702 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RXRBP28702 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RXRBP28702 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RXRBP28702 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RXRBP28702 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RXRBP28702 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RXRBP28702 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RXRBP28702 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RXRBP28702 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RXRBP28702 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RXRBP28702 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RXRBP28702 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RXRBP28702 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RXRBP28702 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RXRBP28702 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RXRBP28702 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RXRBP28702 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RXRBP28702 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RXRBP28702 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RXRBP28702 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RXRBP28702 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RXRBP28702 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RXRBP28702 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RXRBP28702 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RXRBP28702 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RXRBP28702 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RXRBP28702 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RXRBP28702 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RXRBP28702 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RXRBP28702 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RXRBP28702 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RXRBP28702 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RXRBP28702 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RXRBP28702 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RXRBP28702 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RXRBP28702 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RXRBP28702 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RXRBP28702 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RXRBP28702 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RXRBP28702 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RXRBP28702 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RXRBP28702 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RXRBP28702 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RXRBP28702 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RXRBP28702 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RXRBP28702 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RXRBP28702 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RXRBP28702 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RXRBP28702 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RXRBP28702 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RXRBP28702 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RXRBP28702 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RXRBP28702 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RXRBP28702 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RXRBP28702 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RXRBP28702 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RXRBP28702 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RXRBP28702 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RXRBP28702 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RXRBP28702 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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RXRBP28702 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RXRBP28702 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RXRBP28702 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RXRBP28702 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RXRBP28702 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RXRBP28702 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RXRBP28702 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RXRBP28702 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RXRBP28702 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RXRBP28702 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RXRBP28702 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RXRBP28702 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RXRBP28702 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RXRBP28702 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RXRBP28702 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RXRBP28702 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RXRBP28702 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RXRBP28702 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RXRBP28702 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RXRBP28702 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RXRBP28702 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RXRBP28702 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RXRBP28702 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RXRBP28702 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RXRBP28702 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RXRBP28702 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RXRBP28702 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RXRBP28702 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RXRBP28702 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RXRBP28702 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RXRBP28702 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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