Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRB3P28472 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB3P28472 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms