Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRHP20396 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRHP20396 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRHP20396 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRHP20396 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRHP20396 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRHP20396 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TRHP20396 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRHP20396 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRHP20396 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRHP20396 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRHP20396 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRHP20396 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRHP20396 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRHP20396 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRHP20396 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRHP20396 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRHP20396 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRHP20396 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRHP20396 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRHP20396 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRHP20396 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRHP20396 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRHP20396 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRHP20396 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRHP20396 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRHP20396 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRHP20396 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TRHP20396 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRHP20396 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRHP20396 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TRHP20396 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TRHP20396 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRHP20396 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRHP20396 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRHP20396 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TRHP20396 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TRHP20396 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRHP20396 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TRHP20396 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRHP20396 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRHP20396 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRHP20396 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRHP20396 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRHP20396 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRHP20396 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRHP20396 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRHP20396 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRHP20396 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRHP20396 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRHP20396 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRHP20396 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRHP20396 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRHP20396 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRHP20396 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRHP20396 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRHP20396 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TRHP20396 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRHP20396 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TRHP20396 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRHP20396 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRHP20396 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRHP20396 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRHP20396 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRHP20396 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRHP20396 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRHP20396 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRHP20396 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRHP20396 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRHP20396 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRHP20396 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRHP20396 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRHP20396 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRHP20396 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRHP20396 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRHP20396 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRHP20396 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRHP20396 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRHP20396 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRHP20396 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRHP20396 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRHP20396 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRHP20396 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TRHP20396 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRHP20396 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TRHP20396 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRHP20396 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRHP20396 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRHP20396 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TRHP20396 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TRHP20396 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRHP20396 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRHP20396 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRHP20396 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRHP20396 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRHP20396 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRHP20396 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRHP20396 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRHP20396 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRHP20396 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
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