Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHCEP18577 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RHCEP18577 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RHCEP18577 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RHCEP18577 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHCEP18577 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHCEP18577 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHCEP18577 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHCEP18577 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHCEP18577 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RHCEP18577 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHCEP18577 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHCEP18577 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHCEP18577 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHCEP18577 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHCEP18577 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHCEP18577 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHCEP18577 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHCEP18577 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHCEP18577 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHCEP18577 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHCEP18577 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHCEP18577 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHCEP18577 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHCEP18577 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHCEP18577 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHCEP18577 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHCEP18577 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RHCEP18577 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHCEP18577 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RHCEP18577 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHCEP18577 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHCEP18577 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHCEP18577 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHCEP18577 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHCEP18577 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHCEP18577 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHCEP18577 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHCEP18577 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHCEP18577 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RHCEP18577 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHCEP18577 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHCEP18577 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHCEP18577 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHCEP18577 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RHCEP18577 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RHCEP18577 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHCEP18577 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHCEP18577 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHCEP18577 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHCEP18577 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHCEP18577 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHCEP18577 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHCEP18577 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHCEP18577 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHCEP18577 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHCEP18577 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHCEP18577 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHCEP18577 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHCEP18577 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHCEP18577 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHCEP18577 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHCEP18577 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHCEP18577 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHCEP18577 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RHCEP18577 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHCEP18577 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RHCEP18577 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHCEP18577 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHCEP18577 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHCEP18577 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHCEP18577 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHCEP18577 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHCEP18577 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHCEP18577 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHCEP18577 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RHCEP18577 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHCEP18577 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHCEP18577 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHCEP18577 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RHCEP18577 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHCEP18577 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHCEP18577 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHCEP18577 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RHCEP18577 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHCEP18577 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHCEP18577 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHCEP18577 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHCEP18577 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHCEP18577 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHCEP18577 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHCEP18577 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RHCEP18577 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHCEP18577 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHCEP18577 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHCEP18577 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHCEP18577 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHCEP18577 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RHCEP18577 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHCEP18577 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms