Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA1P17302 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA1P17302 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA1P17302 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA1P17302 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA1P17302 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA1P17302 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA1P17302 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA1P17302 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA1P17302 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA1P17302 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA1P17302 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA1P17302 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA1P17302 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA1P17302 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA1P17302 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA1P17302 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA1P17302 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA1P17302 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA1P17302 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA1P17302 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA1P17302 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA1P17302 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA1P17302 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA1P17302 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA1P17302 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA1P17302 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA1P17302 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA1P17302 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA1P17302 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA1P17302 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA1P17302 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA1P17302 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA1P17302 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA1P17302 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA1P17302 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA1P17302 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA1P17302 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA1P17302 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA1P17302 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA1P17302 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA1P17302 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA1P17302 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA1P17302 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA1P17302 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA1P17302 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA1P17302 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA1P17302 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA1P17302 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA1P17302 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA1P17302 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA1P17302 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA1P17302 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA1P17302 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA1P17302 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA1P17302 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA1P17302 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA1P17302 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA1P17302 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA1P17302 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA1P17302 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA1P17302 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA1P17302 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA1P17302 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA1P17302 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA1P17302 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA1P17302 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA1P17302 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA1P17302 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA1P17302 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA1P17302 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA1P17302 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA1P17302 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA1P17302 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA1P17302 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA1P17302 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA1P17302 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA1P17302 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA1P17302 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA1P17302 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA1P17302 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA1P17302 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA1P17302 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA1P17302 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA1P17302 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA1P17302 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA1P17302 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA1P17302 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA1P17302 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA1P17302 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA1P17302 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA1P17302 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA1P17302 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA1P17302 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA1P17302 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA1P17302 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA1P17302 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA1P17302 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA1P17302 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA1P17302 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms