Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GP1BBP13224 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms