Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODC1P11926 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODC1P11926 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODC1P11926 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODC1P11926 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODC1P11926 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODC1P11926 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODC1P11926 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODC1P11926 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODC1P11926 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODC1P11926 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODC1P11926 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ODC1P11926 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODC1P11926 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ODC1P11926 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODC1P11926 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODC1P11926 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODC1P11926 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODC1P11926 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODC1P11926 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODC1P11926 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODC1P11926 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODC1P11926 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODC1P11926 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODC1P11926 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ODC1P11926 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODC1P11926 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODC1P11926 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODC1P11926 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODC1P11926 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODC1P11926 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODC1P11926 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODC1P11926 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODC1P11926 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODC1P11926 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODC1P11926 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODC1P11926 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODC1P11926 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODC1P11926 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ODC1P11926 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODC1P11926 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODC1P11926 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODC1P11926 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODC1P11926 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODC1P11926 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ODC1P11926 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODC1P11926 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ODC1P11926 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODC1P11926 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODC1P11926 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ODC1P11926 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODC1P11926 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODC1P11926 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODC1P11926 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODC1P11926 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ODC1P11926 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODC1P11926 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODC1P11926 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODC1P11926 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODC1P11926 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODC1P11926 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODC1P11926 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODC1P11926 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODC1P11926 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODC1P11926 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODC1P11926 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODC1P11926 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODC1P11926 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODC1P11926 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODC1P11926 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODC1P11926 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ODC1P11926 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODC1P11926 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODC1P11926 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODC1P11926 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODC1P11926 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ODC1P11926 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODC1P11926 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODC1P11926 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODC1P11926 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODC1P11926 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODC1P11926 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODC1P11926 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODC1P11926 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODC1P11926 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODC1P11926 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODC1P11926 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODC1P11926 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODC1P11926 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODC1P11926 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ODC1P11926 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ODC1P11926 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ODC1P11926 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ODC1P11926 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ODC1P11926 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ODC1P11926 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ODC1P11926 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ODC1P11926 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ODC1P11926 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ODC1P11926 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms