Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRCP08575 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRCP08575 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
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