Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTMAP06454 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTMAP06454 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTMAP06454 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTMAP06454 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTMAP06454 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTMAP06454 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTMAP06454 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTMAP06454 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTMAP06454 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTMAP06454 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTMAP06454 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTMAP06454 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTMAP06454 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTMAP06454 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTMAP06454 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTMAP06454 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTMAP06454 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTMAP06454 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTMAP06454 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTMAP06454 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTMAP06454 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTMAP06454 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTMAP06454 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTMAP06454 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTMAP06454 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTMAP06454 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTMAP06454 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTMAP06454 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTMAP06454 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTMAP06454 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTMAP06454 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTMAP06454 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTMAP06454 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTMAP06454 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTMAP06454 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTMAP06454 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTMAP06454 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTMAP06454 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTMAP06454 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTMAP06454 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTMAP06454 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTMAP06454 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTMAP06454 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTMAP06454 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTMAP06454 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTMAP06454 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTMAP06454 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTMAP06454 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTMAP06454 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTMAP06454 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTMAP06454 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTMAP06454 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTMAP06454 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTMAP06454 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTMAP06454 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTMAP06454 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTMAP06454 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTMAP06454 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTMAP06454 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTMAP06454 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTMAP06454 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTMAP06454 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PTMAP06454 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTMAP06454 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTMAP06454 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTMAP06454 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTMAP06454 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTMAP06454 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTMAP06454 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTMAP06454 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTMAP06454 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTMAP06454 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PTMAP06454 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTMAP06454 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTMAP06454 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTMAP06454 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTMAP06454 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTMAP06454 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTMAP06454 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTMAP06454 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTMAP06454 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTMAP06454 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTMAP06454 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTMAP06454 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTMAP06454 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTMAP06454 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTMAP06454 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTMAP06454 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTMAP06454 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTMAP06454 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTMAP06454 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTMAP06454 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTMAP06454 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTMAP06454 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTMAP06454 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTMAP06454 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTMAP06454 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTMAP06454 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTMAP06454 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms