Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
F13BP05160 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
F13BP05160 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
F13BP05160 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
F13BP05160 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
F13BP05160 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
F13BP05160 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
F13BP05160 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
F13BP05160 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
F13BP05160 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
F13BP05160 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
F13BP05160 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
F13BP05160 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.04■□□□□ -0
F13BP05160 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
F13BP05160 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
F13BP05160 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
F13BP05160 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
F13BP05160 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
F13BP05160 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
F13BP05160 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
F13BP05160 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
F13BP05160 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
F13BP05160 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
F13BP05160 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
F13BP05160 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
F13BP05160 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
F13BP05160 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
F13BP05160 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
F13BP05160 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
F13BP05160 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
F13BP05160 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
F13BP05160 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
F13BP05160 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
F13BP05160 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.03■□□□□ -0
F13BP05160 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
F13BP05160 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
F13BP05160 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
F13BP05160 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
F13BP05160 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
F13BP05160 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
F13BP05160 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.03■□□□□ -0
F13BP05160 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.03■□□□□ -0
F13BP05160 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
F13BP05160 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
F13BP05160 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
F13BP05160 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
F13BP05160 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.03■□□□□ -0
F13BP05160 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
F13BP05160 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
F13BP05160 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
F13BP05160 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.03■□□□□ -0
F13BP05160 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.03■□□□□ -0
F13BP05160 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
F13BP05160 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
F13BP05160 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
F13BP05160 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
F13BP05160 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
F13BP05160 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
F13BP05160 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
F13BP05160 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
F13BP05160 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
F13BP05160 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
F13BP05160 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
F13BP05160 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
F13BP05160 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
F13BP05160 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
F13BP05160 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
F13BP05160 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
F13BP05160 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
F13BP05160 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
F13BP05160 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
F13BP05160 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
F13BP05160 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
F13BP05160 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
F13BP05160 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
F13BP05160 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
F13BP05160 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
F13BP05160 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.02■□□□□ -0
F13BP05160 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.02■□□□□ -0
F13BP05160 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
F13BP05160 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
F13BP05160 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
F13BP05160 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
F13BP05160 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
F13BP05160 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.02■□□□□ -0
F13BP05160 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
F13BP05160 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.02■□□□□ -0
F13BP05160 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
F13BP05160 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
F13BP05160 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
F13BP05160 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
F13BP05160 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
F13BP05160 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
F13BP05160 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
F13BP05160 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
F13BP05160 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.02■□□□□ -0
F13BP05160 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
F13BP05160 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
F13BP05160 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
F13BP05160 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms