Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYBBP04839 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYBBP04839 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CYBBP04839 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CYBBP04839 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYBBP04839 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYBBP04839 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYBBP04839 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYBBP04839 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYBBP04839 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYBBP04839 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYBBP04839 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYBBP04839 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYBBP04839 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYBBP04839 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYBBP04839 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYBBP04839 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYBBP04839 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYBBP04839 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CYBBP04839 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYBBP04839 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CYBBP04839 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYBBP04839 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYBBP04839 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CYBBP04839 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYBBP04839 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYBBP04839 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYBBP04839 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYBBP04839 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CYBBP04839 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYBBP04839 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYBBP04839 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYBBP04839 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYBBP04839 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYBBP04839 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYBBP04839 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYBBP04839 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYBBP04839 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYBBP04839 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYBBP04839 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYBBP04839 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYBBP04839 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYBBP04839 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYBBP04839 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYBBP04839 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYBBP04839 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYBBP04839 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYBBP04839 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYBBP04839 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYBBP04839 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYBBP04839 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYBBP04839 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYBBP04839 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYBBP04839 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYBBP04839 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYBBP04839 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYBBP04839 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYBBP04839 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYBBP04839 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CYBBP04839 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CYBBP04839 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYBBP04839 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYBBP04839 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYBBP04839 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYBBP04839 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYBBP04839 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYBBP04839 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYBBP04839 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYBBP04839 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYBBP04839 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CYBBP04839 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CYBBP04839 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYBBP04839 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYBBP04839 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYBBP04839 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYBBP04839 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYBBP04839 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYBBP04839 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYBBP04839 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYBBP04839 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYBBP04839 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYBBP04839 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYBBP04839 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYBBP04839 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYBBP04839 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYBBP04839 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYBBP04839 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYBBP04839 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYBBP04839 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYBBP04839 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYBBP04839 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CYBBP04839 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CYBBP04839 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYBBP04839 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYBBP04839 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYBBP04839 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CYBBP04839 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYBBP04839 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYBBP04839 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYBBP04839 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms