Protein–RNA interactions for Protein: P04279

SEMG1, Semenogelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMG1P04279 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMG1P04279 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMG1P04279 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMG1P04279 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMG1P04279 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMG1P04279 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMG1P04279 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMG1P04279 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMG1P04279 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMG1P04279 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMG1P04279 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMG1P04279 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMG1P04279 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMG1P04279 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMG1P04279 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMG1P04279 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMG1P04279 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMG1P04279 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMG1P04279 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMG1P04279 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMG1P04279 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMG1P04279 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMG1P04279 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMG1P04279 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMG1P04279 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMG1P04279 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMG1P04279 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMG1P04279 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMG1P04279 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMG1P04279 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMG1P04279 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMG1P04279 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMG1P04279 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMG1P04279 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEMG1P04279 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEMG1P04279 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEMG1P04279 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEMG1P04279 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEMG1P04279 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEMG1P04279 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEMG1P04279 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEMG1P04279 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEMG1P04279 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEMG1P04279 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMG1P04279 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms