Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SPTA1P02549 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SPTA1P02549 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SPTA1P02549 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SPTA1P02549 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SPTA1P02549 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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