Protein–RNA interactions for Protein: O43711

TLX3, T-cell leukemia homeobox protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLX3O43711 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TLX3O43711 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TLX3O43711 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TLX3O43711 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TLX3O43711 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TLX3O43711 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TLX3O43711 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TLX3O43711 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TLX3O43711 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TLX3O43711 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TLX3O43711 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLX3O43711 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLX3O43711 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLX3O43711 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TLX3O43711 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLX3O43711 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLX3O43711 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLX3O43711 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TLX3O43711 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLX3O43711 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLX3O43711 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLX3O43711 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLX3O43711 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLX3O43711 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLX3O43711 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TLX3O43711 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLX3O43711 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLX3O43711 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TLX3O43711 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLX3O43711 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLX3O43711 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLX3O43711 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLX3O43711 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLX3O43711 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLX3O43711 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLX3O43711 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLX3O43711 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLX3O43711 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLX3O43711 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLX3O43711 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLX3O43711 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLX3O43711 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLX3O43711 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLX3O43711 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLX3O43711 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLX3O43711 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TLX3O43711 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLX3O43711 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLX3O43711 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLX3O43711 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLX3O43711 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLX3O43711 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLX3O43711 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLX3O43711 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLX3O43711 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLX3O43711 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLX3O43711 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLX3O43711 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLX3O43711 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLX3O43711 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLX3O43711 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TLX3O43711 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLX3O43711 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLX3O43711 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLX3O43711 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLX3O43711 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TLX3O43711 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TLX3O43711 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TLX3O43711 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLX3O43711 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLX3O43711 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLX3O43711 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLX3O43711 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLX3O43711 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLX3O43711 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLX3O43711 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLX3O43711 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLX3O43711 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLX3O43711 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLX3O43711 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLX3O43711 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLX3O43711 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLX3O43711 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLX3O43711 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLX3O43711 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLX3O43711 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLX3O43711 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLX3O43711 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLX3O43711 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLX3O43711 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLX3O43711 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLX3O43711 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLX3O43711 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLX3O43711 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLX3O43711 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLX3O43711 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLX3O43711 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLX3O43711 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLX3O43711 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TLX3O43711 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms