Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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NDUFS4O43181 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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NDUFS4O43181 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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