Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBDO15205 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBDO15205 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBDO15205 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UBDO15205 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UBDO15205 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UBDO15205 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBDO15205 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UBDO15205 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBDO15205 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBDO15205 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBDO15205 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UBDO15205 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBDO15205 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UBDO15205 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBDO15205 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UBDO15205 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBDO15205 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UBDO15205 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBDO15205 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBDO15205 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBDO15205 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBDO15205 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBDO15205 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBDO15205 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBDO15205 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBDO15205 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBDO15205 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBDO15205 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UBDO15205 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBDO15205 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBDO15205 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBDO15205 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBDO15205 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBDO15205 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBDO15205 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBDO15205 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBDO15205 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBDO15205 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UBDO15205 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBDO15205 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBDO15205 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBDO15205 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBDO15205 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBDO15205 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBDO15205 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBDO15205 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBDO15205 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBDO15205 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBDO15205 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBDO15205 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UBDO15205 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBDO15205 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBDO15205 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBDO15205 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBDO15205 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBDO15205 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBDO15205 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBDO15205 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBDO15205 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBDO15205 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBDO15205 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBDO15205 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBDO15205 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBDO15205 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBDO15205 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UBDO15205 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UBDO15205 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBDO15205 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBDO15205 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
UBDO15205 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
UBDO15205 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBDO15205 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBDO15205 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBDO15205 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBDO15205 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBDO15205 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBDO15205 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBDO15205 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBDO15205 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBDO15205 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBDO15205 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UBDO15205 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBDO15205 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBDO15205 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBDO15205 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBDO15205 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBDO15205 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBDO15205 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBDO15205 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBDO15205 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBDO15205 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBDO15205 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBDO15205 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBDO15205 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UBDO15205 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBDO15205 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBDO15205 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBDO15205 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UBDO15205 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms