Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms