Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4E171 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4E171 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4E171 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4E171 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
B4E171 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4E171 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
B4E171 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4E171 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4E171 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4E171 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4E171 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
B4E171 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4E171 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4E171 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4E171 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4E171 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4E171 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4E171 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4E171 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4E171 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4E171 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4E171 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4E171 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4E171 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4E171 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4E171 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4E171 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4E171 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4E171 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4E171 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4E171 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4E171 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4E171 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
B4E171 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4E171 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4E171 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4E171 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4E171 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4E171 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4E171 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4E171 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4E171 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4E171 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4E171 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4E171 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4E171 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4E171 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4E171 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms