Protein–RNA interactions for Protein: A6NMD2

GOLGA8J, Golgin subfamily A member 8J, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8JA6NMD2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GOLGA8JA6NMD2 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GOLGA8JA6NMD2 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GOLGA8JA6NMD2 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms