Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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PRAMEF25A6NGN4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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