Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms