Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAPPC4Q9Y296 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms