Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6Q9Y252 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF6Q9Y252 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms