Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PADI1Q9ULC6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms