Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms