Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms