Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CFDP1Q9UEE9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.4 ms