Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms