Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC88CQ9P219 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms