Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC180Q9P1Z9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms