Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CALCOCO1Q9P1Z2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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