Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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