Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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RDH8Q9NYR8 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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RDH8Q9NYR8 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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RDH8Q9NYR8 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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RDH8Q9NYR8 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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RDH8Q9NYR8 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RDH8Q9NYR8 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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