Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYH9

UTP6, U3 small nucleolar RNA-associated protein 6 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP6Q9NYH9 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP6Q9NYH9 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP6Q9NYH9 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP6Q9NYH9 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP6Q9NYH9 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP6Q9NYH9 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
UTP6Q9NYH9 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
UTP6Q9NYH9 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UTP6Q9NYH9 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms