Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms