Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNAJC28Q9NX36 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms