Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms