Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms