Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FZD3Q9NPG1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms