Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms