Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms