Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFGAP3Q9NP61 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFGAP3Q9NP61 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFGAP3Q9NP61 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFGAP3Q9NP61 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFGAP3Q9NP61 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFGAP3Q9NP61 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFGAP3Q9NP61 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFGAP3Q9NP61 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFGAP3Q9NP61 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFGAP3Q9NP61 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFGAP3Q9NP61 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFGAP3Q9NP61 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFGAP3Q9NP61 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFGAP3Q9NP61 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFGAP3Q9NP61 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFGAP3Q9NP61 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFGAP3Q9NP61 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFGAP3Q9NP61 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFGAP3Q9NP61 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFGAP3Q9NP61 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFGAP3Q9NP61 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFGAP3Q9NP61 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFGAP3Q9NP61 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFGAP3Q9NP61 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFGAP3Q9NP61 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFGAP3Q9NP61 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFGAP3Q9NP61 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFGAP3Q9NP61 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFGAP3Q9NP61 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFGAP3Q9NP61 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFGAP3Q9NP61 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFGAP3Q9NP61 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFGAP3Q9NP61 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFGAP3Q9NP61 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFGAP3Q9NP61 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFGAP3Q9NP61 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFGAP3Q9NP61 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFGAP3Q9NP61 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFGAP3Q9NP61 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFGAP3Q9NP61 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFGAP3Q9NP61 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ARFGAP3Q9NP61 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ARFGAP3Q9NP61 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ARFGAP3Q9NP61 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms