Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms