Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP29Q9HBJ7 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms