Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIN28AQ9H9Z2 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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