Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRDM12Q9H4Q4 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms