Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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BPESC1Q9GZL8 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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BPESC1Q9GZL8 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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BPESC1Q9GZL8 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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BPESC1Q9GZL8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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BPESC1Q9GZL8 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BPESC1Q9GZL8 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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