Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms