Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZCCHC2Q9C0B9 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms